جلسه دفاع پایان نامه: آرین نظرزاده، گروه مهندسی پزشکی-بیوالکترونیک
عنوان پایان نامه: قطعه بندی لایه های پوست در تصاویر فراصوت بیماری های التهابی با یادگیری عمیق
ارائه کننده: آرین نظرزاده استاد راهنما: دکتر علی محلوجی فر استاد ناظر داخلی اول: دکتر بابک محمدزاده اصل استاد ناظر خارجی اول: دکتر حمید بهنام (دانشگاه علم و صنعت) تاریخ: ۱۴۰۳/۰۴/۰۴ ساعت: ۸:۳۰ تا ۱۰ مکان: آزمایشگاه دکتر محمدزاده
چکیده: در بیماری های التهابی پوست، بررسی لایه های پوست با استفاده از تصویربرداری پزشکی امری مهم جهت تشخیص و درمان است و تصویربرداری فراصوت این امر را ممکن می سازد. در بیماران دارای psoriasis و Atopic dermatitis، قطعه بندی دقیق لایه های پوست ارزیابی روند درمان را ممکن می سازد. بررسی لایه ی اپیدرم وSLEB جهت تشخیص بسیار حائز اهمیت هستند، زیرا شکل و ظاهر آن ها نشان دهنده ی مشکلات مختلف پوست است. در فرآیند تشخیص پزشکی، قطعه بندی و بررسی تصویر توسط پزشک متخصص انجام می شود که این خود دارای محدودیت هاییاست، از جمله وقت گیر بودن و تکرارپذیر نبودن. اخیرا استفاده از تصویربرداری فراصوت در فرآیند پزشکی پوست بیشتر شده است، اما ابزارهای خودکار هوش مصنوعی به اندازه ی کافی برای آن توسعه داده نشده اند. در این تحقیق، با استفاده از یادگیری عمیق، به قطعه بندی تصاویر فراصوت پوست با استفاده از یک شبکه ی عصبی مصنوعی عمیق با معماری U-Net می پردازیم. پایگاه داده اصلی شامل ۳۸۰ تصویر التراسوند پوست افراد دارای بیماری پوستی اتهابی (۷۷ تصویر psoriasis و ۳۰۳ تصویر Atopic dermatitis) است. هدف، قطعه بندی دو لایه ی epidermis و SLEB در تصاویر پوست است. برای هر تصویر یک ماسک متناظر قطعه بندی شده داریم که همراه با هم به شبکه داده می شوند. قسمت encoder شبکه ی U-Net با استفاده از back boneهاییمانند VGG، MobileNet و ResNext تغییر کرده است. این encoderها با وزن های پایگاه داده ی imagenet در معماری قرار گرفته اند. در نهایت شبکه برای هر داده ی تست، تصویری به عنوان خروجی به ما می دهد که آن را با ماسک مقایسه کرده و نتیجه را در غالب معیار Dice index اعلام می کنیم. شبکه با MobileNet V۲ encoder بهترین نتیجه را حاصل کرد؛ dice برابر با ۰.۸۸ برای اپیدرم و ۰.۸۶ برای SLEB. در تمامی شبکه های اجرا شده، نتیجه ی قطعه بندی لایه ی اپیدرم بهتر از SLEB بود.